일본의 땅은 내전으로 분열되어 있고, 다른 파벌의 지도자들은 그들이 수행해야 할 비밀 임무들을 가지고 있다. 4개의 위대한 닌자 씨족 중 하나로서 당신은 전사를 훈련시켜야 합니다. 그래야 그들이 주어진 임무를 수행할 준비가 됩니다. 하지만 주의하세요, 너무 오래 걸리면 당신의 라이벌 종족들 중 하나가 당신 앞에서 임무를 수행할 수 있고, 그것을 수행하는 대가로 제공되는 풍부한 보상을 훔칠 수 있습니다.

시노비에서: Way of Ninja는 닌자 클랜을 조종하며 부를 얻고 게임에서 승리하기 위해 여러 가지 미션을 수행해야 합니다. 수행해야 할 미션(작업)과 미션 수행 위치, 미션 수행에 방해가 될 수 있는 문제(규정)를 알려주는 세 가지 미션 카드가 표시됩니다. 이러한 각 작업을 수행하려면 하나 이상의 스킬 카드가 필요합니다. 예를 들어, 임무에 비무장 전투 사용이 필요한 경우 스킬 카드를 재생해야 수행할 수 있습니다.

필요한 스킬 카드를 모두 모으면 미션을 수행하여 클랜에게 보상을 받을 수 있습니다. 불행히도 당신은 임무를 바로 수행할 수 있는 적절한 카드를 손에 쥐는 일이 거의 없을 것이다. 대신, 당신은 당신이 조종하는 두 개의 도호 중 하나에 카드를 손에서 뒤집어 놓음으로써 나중에 사용할 수 있도록 당신의 손에서 카드를 보관해야 할 것이다. 이런 식으로 카드를 보관하는 것은 당신의 부족의 닌자들이 임무를 수행하도록 훈련시키는 것을 나타냅니다.

일반적으로 카드를 한 번 배치하면 카드를 검사할 수 없기 때문에 각 도조에 배치된 카드를 추적하는 것은 어렵습니다. 집중력과 기억력을 발휘해 어떤 카드를 꽂았는지 기억해야 미션을 수행할 준비가 되었을 때 카드를 사용할 수 있다. 비록 이것이 처음에는 어렵지만, 여러분은 정신 능력이 빠르게 날카로워지고 게임에 점점 더 능숙해질 것이라는 것을 알게 될 것입니다. 닌자 일족의 대장이 되기 위해서는 엄청난 정신력이 필요하다. Way of Ninja는 최선을 다해 시험할 것입니다. 하지만, 만약 여러분이 완전히 막히게 된다면, 여러분은 언제든지 (유료로) 여러분이 놓은 카드를 검사할 수 있는 선생님들을 방문할 수 있습니다.

각각의 임무를 금의 형태로 완수하면 보상을 받게 됩니다. 미션이 힘들수록 더 많은 골드를 받게 되지만, 미션을 수행하기 위해서는 더 많은 카드가 필요합니다. 게임이 끝나면 가장 큰 재산을 축적한 플레이어가 승리합니다.

The land of Nippon is riven by civil war and the leaders of the different factions have a number of secret missions they need carried out. As master of one of the four great Ninja clans you must train your warriors so they are ready to carry out the missions offered. But beware, if you take too long one of your rival clans may undertake a mission before you and steal the rich reward offered for carrying it out.

In Shinobi: Way of the Ninja, you control a ninja clan and must perform different missions in order to obtain wealth and win the game. The missions you are called on to carry out are represented by three Mission cards that will tell you what you need to do (the task), where the mission is to be carried out (the location), and what problems may arise that will hinder you in the missions execution (complications). Each of these things requires one or more Skill cards from your hand to overcome. For example, if the mission required the use of unarmed combat you would need to play that Skill card in order to carry it out.

Once you have collected all of the Skill cards you need you may carry out a mission and reap the rewards for your clan. Unfortunately you will rarely have the right cards in your hand to perform a mission straight away. Instead you will need to store cards from your hand for future use by placing cards face-down from your hand into one of two dojos you control. Storing cards in this way represents you training the ninjas in your clan to perform a mission.

Keeping track of the cards placed in each dojo is challenging as you are not normally allowed to examine the cards once they are placed. You must use your powers of concentration and memory to remember which cards you have placed so that you can use them when you are ready to carry out a mission. Although this is difficult at first, you will find that your mental abilities quickly sharpen and that you will become increasingly skilled at the game. This is as it should be: being the master of a ninja clan requires great mental fortitude, and Shinobi: Way of the Ninja will test it to the utmost. However, if you get completely stuck, you can always visit the sensei who will (at a cost) allow you to examine the cards you have placed.

You receive a reward for completing each mission in the form of gold. The harder a mission the more gold you will receive, but the more cards you will need to play to carry the mission out. At the end of the game the player who has amassed the largest fortune wins.